Ich arbeite nicht mit Hugin, sondern mit PTGui, daher können einige Begriffe vielleicht anders übersetzt sein.
Vielleicht bist Du im Panorama-Editor aus Versehen oder aus Unwissenheit nur mal mit der Maus ausgerutscht, und hast damit einen taumelnden Horizont erzeugt. Das geht ganz schnell, wenn man nicht aufpasst. Manchmal will man "nur" das Hauptmotiv in die Mitte ziehen, und zerstört damit die gesamte Ausrichtung. War das hier so?
Die Wasserwaage kannst Du übrigens bei Kugelpanoramen getrost zu Hause lassen, denn sie nützt Dir gar nichts. Kugelpanos kann man nachträglich in jede gewünschte Richtung kullern, egal wie gerade oder wie schräg sie fotografiert wurden. Die Einzelbilder nutzen in diesem Zusammenhang auch nichts. Man kann aus ihnen ein gerades oder ein schräges Pano herstellen, ganz nach Belieben. Schräg machen geht mit einem einzigen Mauszug. Geradestellen im Prinzip mt wenigen Mausbewegungen, wenn man GENAU weiß, wo man anfassen und schieben bzw. drehen muss.
Steht aber schon alles
hier im Forum beschrieben. Auch wenn's für PTGui ist, funktioniert es in Hugin sicher ähnlich.