Wenn ich dich richtig verstanden habe ist der Punkt auf der längeren Seite des Sensors nicht in der Mitte, richtig? Das kann ja (logischerweise) nur an einer Verdrehung der Kamera oder an einer Verschiebung liegen. Also kontrollieren ob die Kameraplatte richtig in der Halterung sitzt und nicht dezentriert ist. Ansonsten muss die Kameraplatte auf der 5D verdreht werden.
Ich halte aber nicht ganz so viel von der Schrauben-Methode um Drehung der Kamera einzustellen. (zumindest bei 1-reihigen Pano-Setups) Denn selbst sehr hochwertige NPAs (Manfrotto, Novoflex, NN, etc.) haben immernoch ein gewisses Spiel. Daher stelle ich die Drehung der Kamera immer mit Hilfe eines Winkels in der horizontalen Position ein. Durch das Gewicht der Kamera bekommt man so zwei minimal verschiedene Ergebnisse.
Gruß,
WALL*E