Nadirstempeln mach ich schon lange nicht mehr, das dauert einfach zu lange und ist auch immer irgendwie unbefriedigend, vor allem, wenn zu wenige Quell-Pixel da sind. Ein zusätzliches Nadirbild hat sich bei mir allerbestens bewährt. Das würde im gezeigten Pano sogar doppelt gut sein. Zum Einen deckst Du den Bereich mit originalen, ungestempelten Pixeln ab. Zum Zweiten überdeckt das Nadirbild einen guten Teil der Unschärfen- Und noch ein Drittes: Durch das zusätzliche Bild werden auch zusätzliche Kontrollpunkte erzeugt, die den Nadir insgesamt passender zurechtrücken.
Diesen Effekt solltest Du aber auch ohne weiteres Bild hinbekommen, indem Du die vorhandenen Kontrollpunkte besser optimierst. Ich vermute, dass Du nahe am Nadir (fast) keine hast? Dann setze dort mal welche! Nutze einfach die Halbautomatik, also ziehe einen Rahmen auf, wo PTGui selbst CPs findet, die sind (bis auf einzelne Ausreißer) oft besser als vollmanuelle CPs.
Falls die Software sich dann noch weigern sollte, diese Bereiche ordentlich zu gestalten, dann vermute ich, dass der Nodalpunkt mal kontrolliert werden muss.