Ich arbeite nicht mit Lightroom, und kenne deswegen dessen genaues Verhalten nicht. Aber jeder RAW-Entwickler muß die Dateien erst mal irgendwie interpretieren, sonst siehst du nichts. Woher weisst du denn, daß Lightroom deine Dateien "verändert"? Sehen sie anders aus als parallel aufgezeichnete JPEG? An denen hat die Kamera (je nach Einstellung dort) schon fleissig rumgedreht.
Wenn du alle Auto-Einstellungen deaktiviert hast, dann zeigt dir vermutlich auch Lightroom (so wie alle andern Konverter) ein Bild, das nur nach den parallel in der Kamera mitgeschriebenen Werten (z.B. Weissabgleich) interpretiert wird, und mit nichts weiterem. Eine "Interpretation" ist eine RAW-Konvertierung aber zwangsläufig immer. Deswegen sieht dasselbe Bild in unterschiedlichen Konvertern mit Basiseinstellungen auch immer etwas anders aus. Da führt kein Weg dran vorbei.
Aber vielleicht habe ich ja auch einfach nicht verstanden, was du mit "ändert" meinst...