Hallo,
in so einem Fall würde ich hugin das ohne Zenit-Bild machen lassen und anschließend das verbleibende "Loch" nachträglich retuschieren, bzw. das Bild einfügen, je nachdem wie groß das Loch ist.
Alternativ: Wenn der Himmel nur blau ist, einfach grob geschätzt Kontrollpunkte setzen.
Das ist mir auch mal passiert und seit dem achte ich bei der Zenit-Aufnahme darauf, dass genug "Futter" für Kontrollpunkte da ist, also statt 1 x +90 (180 wäre etwas sehr weit, wenn 0 horizontal ist...) lieber 2 x +60 oder +70
Gruß
Panoramann